Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms