Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS3AP61247 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms