Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms