Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERFP50548 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERFP50548 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms