Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTPAP49638 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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