Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ME1P48163 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms