Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms