Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms