Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RANGAP1P46060 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms