Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms