Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms