Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms