Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms