Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms