Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN6P29350 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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