Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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