Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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APCP25054 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
APCP25054 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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APCP25054 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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APCP25054 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
APCP25054 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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APCP25054 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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APCP25054 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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