Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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