Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms