Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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