Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms