Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

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Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
DMDP11532 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DMDP11532 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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