Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ESRRAP11474 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms