Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI3P10071 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI3P10071 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI3P10071 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI3P10071 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI3P10071 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms