Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms