Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POP4O95707 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms