Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms