Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms