Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms