Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DLL1O00548 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DLL1O00548 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms