Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms