Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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