Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWA8A3KMH1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms