Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SETD1BQ9UPS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1BQ9UPS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1BQ9UPS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms