Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARDHQ9UL12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARDHQ9UL12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms