Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRD1Q9P1U0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms