Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLL3Q9NYJ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms