Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM30AQ9NV96 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM30AQ9NV96 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms