Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIT2Q9NQR4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIT2Q9NQR4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms