Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTAC1Q9NQ79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms