Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP29Q9HBJ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP29Q9HBJ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms