Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIF1Q9H611 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms