Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF18Q99633 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms