Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 YEL077CYEL077C 3834 nt4.59□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YFL034WYFL034W 3222 nt4.59□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 GPT2YKR067W 2232 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 DED81YHR019C 1665 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 HFI1YPL254W 1467 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 VMA16YHR026W 642 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YLL059CYLL059C 507 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 SNN1YNL086W 309 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YPL102CYPL102C 303 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 VPS1YKR001C 2115 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 UBX2YML013W 1755 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 ASN1YPR145W 1719 nt4.58□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 HRP1YOL123W 1605 nt4.57□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 SMF3YLR034C 1422 nt4.57□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 MAK32YCR019W 1092 nt4.57□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.57□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 HXT3YDR345C 1704 nt4.57□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 RRN3YKL125W 1884 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 SPS22YCL048W 1392 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 PAP2YOL115W 1755 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 EGD2YHR193C 525 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 PHO86YJL117W 936 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 GPM3YOL056W 912 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 ABZ1YNR033W 2364 nt4.56□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 RPT4YOR259C 1314 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YDL034WYDL034W 345 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 GIR2YDR152W 798 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 CAD1YDR423C 1230 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 NQM1YGR043C 1002 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YGR176WYGR176W 348 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 SUE1YPR151C 621 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 CDC16YKL022C 2523 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 FOL1YNL256W 2475 nt4.55□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 YFL052WYFL052W 1398 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 GUP2YPL189W 1830 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 PGU1YJR153W 1086 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 MRP17YKL003C 396 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 RPS19BYNL302C 435 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 DAL82YNL314W 768 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 snR32snR32 188 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 NRD1YNL251C 1728 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 SIP5YMR140W 1470 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 JIP4YDR475C 2631 nt4.54□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 RTT106YNL206C 1368 nt4.53□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 SSP120YLR250W 705 nt4.53□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 QRI1YDL103C 1434 nt4.53□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 ERG7YHR072W 2196 nt4.53□□□□□ -1.68
ATG40Q99325 CMR1YDL156W 1569 nt4.53□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 CDC19YAL038W 1503 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 HES1YOR237W 1305 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 SNU71YGR013W 1863 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 YHR045WYHR045W 1683 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 TOS4YLR183C 1470 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 GCS1YDL226C 1059 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 CBC2YPL178W 627 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 STE50YCL032W 1041 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 BUD9YGR041W 1644 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 DBF4YDR052C 2115 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 ULA1YPL003W 1389 nt4.52□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 QDR1YIL120W 1692 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 RPT2YDL007W 1314 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 MTF2YDL044C 1323 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 SCW4YGR279C 1161 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 MND2YIR025W 1107 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 YJL171CYJL171C 1191 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 COS9YKL219W 1224 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 DCN1YLR128W 810 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 SPG4YMR107W 348 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 CAM1YPL048W 1248 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 SET5YHR207C 1581 nt4.51□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 BRF1YGR246C 1791 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 YPL277CYPL277C 1464 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 NUD1YOR373W 2556 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 YMR027WYMR027W 1413 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 YJR115WYJR115W 510 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 RPA49YNL248C 1248 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 LEM3YNL323W 1245 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 BUB3YOR026W 1026 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 RDL2YOR286W 450 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 KIP2YPL155C 2121 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 RAT1YOR048C 3021 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 AAP1YHR047C 2571 nt4.5□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 RML2YEL050C 1182 nt4.49□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 ERP5YHR110W 639 nt4.49□□□□□ -1.69
ATG40Q99325 RPR2YIR015W 435 nt4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms