Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms