Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VOPP1Q96AW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VOPP1Q96AW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms