Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UTP4Q969X6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms