Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms