Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM1BQ8NB78 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM1BQ8NB78 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms