Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VSTM4Q8IW00 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSTM4Q8IW00 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM4Q8IW00 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM4Q8IW00 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms